Čeprav ima cerkev baročno zunanjost, je njena notranjost zelo preprosta. Tako je bilo dovolj prostora, da so v njej obesili slike, ki so nekdaj krasile cerkev sv. Katarine - preden so jo spremenili v telovadnico OŠ Dante Alighieri, ko je bila ta v objektu na Gregorčičevi ulici. Cerkev sv. Janeza so posvetili daljnega leta 1459. Nazadnje so jo obnovili leta 1975, maše pa so v njej darovali v letih 1980 in 1981, ko so obnavljali notranjost bližnje stolne cerkve sv. Mavra.
Vir:
http://www.izola.eu/index.php?page=static&item=47&tree_root=3
http://www.primorske.si/Primorska/Istra/Po-33-letih-znova--odprli-cerkev-sv--Janeza.aspx